19世纪，科托努曾为法国殖民主义者入侵和掠夺的重要据点，后在港口贸易活动的基础上逐步发展起来。1965年建成人工深水港。
科托努港属热带雨林气候，盛行西南风。年平均气温约22～34℃。全年平均降雨量约1300mm。大潮高1.5m。港区主要码头泊位有5个，岸线长1280m，最大水深11m。装卸设备有拖船及直径为150～200mm地输油管及滚装设施等，其中拖船地功率最大为1470kW。港区的库场面积8万平方米，另有集装箱堆场6.5万平方米。有铁路直接延伸至码头装卸。码头最大可靠4万载重吨的船舶。本港保税区仓储西积约6万平方米。1992年集装箱吞吐量为2.8万TEU。主要出口货物为花生、棉花、棕油及棕仁等，进口货物主要有纺织品、机器设备、食品及燃油等，在节假日中如果需要加班，须提前申请安排。
科托努是贝宁的主要贸易港，并在西非中南部地区的内陆国家，如尼日尔、布基纳法索、马里东部和尼日利亚的交通运输中承担着重要任务。这些国家每年都有大量的进出口物资在这里转口。科托努港的年贸易量占贝宁的60－65%，占邻国的35－40%。
